Ως προς τη πανίδα, εδώ βρίσκει καταφύγιο ο Κρητικός λίγκας ή φουρόγατος (Felis silvestris creticus), ο οποίος είναι τόσο σπάνιος που έχει παρατηρηθεί ελάχιστες φορές από επιστήμονες.Ο αγριόγατος (Felis sylvestris) είναι το μοναδικό είδος από τα αιλουροειδή που απαντάται στην Ελλάδα. Ήταν για την Κρήτη ένα ζώο-φάντασμα μέχρι το 1996, oπότε οι φοιτήτριες A. Belardinelli και P. Ciccone, μέλη επιστημονικής αποστολής που μελετούσε τα σαρκοφάγα της Κρήτης, παγίδεψαν έναν αγριόγατο, σε συνεργασία με το Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης. Το ζώο κρατήθηκε για σύντομο χρονικό διάστημα στο Πανεπιστήμιο Κρήτης και, αφού προσαρμόστηκε πάνω του πομπός για ραδιοτηλεμετρική παρακολούθηση, αφέθηκε ελεύθερο και παρακολουθήθηκε για τρεις μήνες.
«Η συγγένεια του κρητικού αγριόγατου, όπως και του αγριόγατου της Σαρδηνίας, με τον αφρικανικό αγριόγατο και όχι με τον ευρωπαϊκό (Felis sylvestris sylvestris) δημιουργεί ερωτήματα για την προέλευση των παραπάνω πληθυσμών. Η μελέτη της βιολογίας του θα φωτίσει θέματα που αφορούν το φυσικό περιβάλλον του νησιού» μας λέει ο διευθυντής του μουσείου, κ. Μ. Μυλωνάς. Πρέπει να επισημανθεί ότι οι πληθυσμοί του ζώου είναι εκτεθειμένοι σε πολλούς κινδύνους, οι οποίοι ενισχύονται από το γεγονός ότι πρόκειται για νησιωτικούς πληθυσμούς που δεν μπορούν να τροφοδοτηθούν από γειτονικούς πληθυσμούς.
Στο δάσος του Ρούβα ζουν κι άλλα θηλαστικά όπως ασβοί, ζουρίδες, καλογυναικάρια (Musteka nivalis), λαγοί, μυγαλές και ποντικοσκίουροι (Glis glis argenteus).
«Η συγγένεια του κρητικού αγριόγατου, όπως και του αγριόγατου της Σαρδηνίας, με τον αφρικανικό αγριόγατο και όχι με τον ευρωπαϊκό (Felis sylvestris sylvestris) δημιουργεί ερωτήματα για την προέλευση των παραπάνω πληθυσμών. Η μελέτη της βιολογίας του θα φωτίσει θέματα που αφορούν το φυσικό περιβάλλον του νησιού» μας λέει ο διευθυντής του μουσείου, κ. Μ. Μυλωνάς. Πρέπει να επισημανθεί ότι οι πληθυσμοί του ζώου είναι εκτεθειμένοι σε πολλούς κινδύνους, οι οποίοι ενισχύονται από το γεγονός ότι πρόκειται για νησιωτικούς πληθυσμούς που δεν μπορούν να τροφοδοτηθούν από γειτονικούς πληθυσμούς.
Στο δάσος του Ρούβα ζουν κι άλλα θηλαστικά όπως ασβοί, ζουρίδες, καλογυναικάρια (Musteka nivalis), λαγοί, μυγαλές και ποντικοσκίουροι (Glis glis argenteus).
Αν περπατήσετε το μονοπάτι από τη λίμνη του Ζαρού, πριν το φαράγγι του Αγίου Νικολάου θα συναντήσετε το μοναστήρι του Αγίου Νικολάου (20’ από τη λίμνη), από όπου ξεκινάει το μονοπάτι. Μετά η διαδρομή μέσα από το πανέμορφο φαράγγι, που είναι οργανωμένη και σηματοδοτημένη, καταλήγει στο μικρό οροπέδιο του Αγίου Ιωάννη με το πρινόδασος μετά από 2 ώρες. Αξίζει να σταθείτε στο γραφικό εκκλησάκι του Αι Γιάννη και να δροσιστείτε από τις γύρω πηγές.. Δύο υπέροχα σημεία του δάσους αποτελούν οι τοποθεσίες «Δυό πρίνοι» στη δυτική πλαγιά από την οποία φαίνεται ολόκληρο το δάσος του Ρούβα και «Σαμάρι» στην ομώνυμη νότια κορυφή με πανοραμική θέα του Ζαρού έως και τον κάμπο της Μεσσαράς. Στο σημείο αυτό βρίσκεται και ένα ορειβατικό καταφύγιο. Επίσης, στα βουνά θα δείτε αρκετά ερειπωμένα μιτάτα, δηλαδή τα χαρακτηριστικά μικρά «τυροκομεία» των βουνών της Κρήτης. Τέλος, το καλοκαίρι οι κάτοικοι της Γέργερης πολύ συχνά διοργανώνουν παραδοσιακά γλέντια κάτω από τα τεράστια πλατάνια του δάσους, τα οποία δεν πρέπει να χάσετε σε καμιά περίπτωση! Ένα τέτοιο γλέντι διοργανώνεται του Τιμίου Σταυρού, όταν γιορτάζει το πανέμορφο ξωκλήσι που βρίσκεται μέσα στο δάσος και είναι κτισμένο με την πέτρα της περιοχής.
Το σημαντικότερο πρόβλημα σήμερα είναι η υπερβόσκηση. Επίσης, πριν από μερικά χρόνια κάηκε μεγάλο τμήμα του δάσους στο φαράγγι από πυρκαγιά με αποτέλεσμα σήμερα η διάβρωση του εδάφους να αποτελεί πρόβλημα. Άλλο πρόβλημα είναι η έλλειψη θηραμάτων, λόγω του αλόγιστου κυνηγιού.
Το σημαντικότερο πρόβλημα σήμερα είναι η υπερβόσκηση. Επίσης, πριν από μερικά χρόνια κάηκε μεγάλο τμήμα του δάσους στο φαράγγι από πυρκαγιά με αποτέλεσμα σήμερα η διάβρωση του εδάφους να αποτελεί πρόβλημα. Άλλο πρόβλημα είναι η έλλειψη θηραμάτων, λόγω του αλόγιστου κυνηγιού.